EEG-analys utförs under registreringen och slutligen efter dess slutförande. Under registreringen bedöms förekomsten av artefakter (induktion av nätverksströmsfält, mekaniska artefakter av elektrodrörelser, elektromyogram, elektrokardiogram, etc.) och åtgärder vidtas för att eliminera dem. EEG:s frekvens och amplitud bedöms, karakteristiska grafiska element identifieras och deras rumsliga och tidsmässiga fördelning bestäms.