I vissa fall, oftare hos kvinnor, börjar akut pyelonefrit med akut cystit (frekvent och smärtsam urinering, smärta i urinblåsan, terminal hematuri). Andra symtom på akut myelonefrit: allmän trötthet, svaghet, muskel- och huvudvärk, aptitlöshet, illamående, kräkningar.