Alla probiotika är indelade i flera grupper beroende på vad som ligger till grund för klassificeringen. Ett probiotika kan innehålla flera komponenter, i detta avseende skiljer man sig åt monokomponentpreparat, som endast har en specifik typ av bakterier. Dessa mikroorganismer är utan tvekan användbara för tarmarna, i synnerhet för mikrofloran.