Studie: gener påverkar fruktens och fibrernas effekt mot cancer

En nyligen publicerad studie i tidskriften eBioMedicine har identifierat genetiska variationer som kan modifiera sambandet mellan fiber-, frukt- och grönsaksintag och risken för kolorektal cancer (CRC). Forskarna lyckades identifiera två signifikanta loci som modifierar sambandet mellan fiber- och fruktintag och risken för CRC.

Kronisk cancer (CRC) är en av de vanligaste cancerformerna i världen, med nästan två miljoner nya fall och över 900 000 dödsfall under 2020. Högt intag av frukt, grönsaker, fullkorn och kostfiber har rapporterats minska risken för CRC. Även om det finns starka bevis för ett samband mellan CRC-risk och intag av fullkorn och kostfiber, är bevisen för ett samband mellan CRC-risk och intag av frukt och grönsaker fortfarande begränsade.

Tidigare genomomfattande associationsstudier (GWAS) har identifierat minst 200 loci associerade med CRC-risk, vilket förklarar upp till 35 % av ärftligheten. Även om gen-miljö (G × E)-interaktioner kan förklara ytterligare ärftlighet, har tidigare studier med små urval och traditionella metoder endast funnit ett begränsat antal signifikanta interaktioner. Nya statistiska metoder, såsom konjunktiva tester och tvåstegsmetoder som prioriterar enstaka nukleotidpolymorfismer (SNP), har potential att förbättra noggrannheten i dessa analyser.

Upp till 45 studier från tre genetiska konsortier för kolorektal cancer, inklusive individer av europeisk härkomst, inkluderades i analysen. Studierna inkluderade fall-kontrollgrupper för kohortstudier och cancerfria kontroller för fall-kontrollstudier. Totalt analyserades 69 599, 69 734 respektive 44 890 deltagare avseende frukt-, grönsaks- och fiberintag. Kostintaget bedömdes med hjälp av frågeformulär om matfrekvens och kosthistorik, vanligtvis uttryckt som portioner per dag för frukt och grönsaker och gram per dag för total fiber.

Data harmoniserades och uttrycktes som kvartilvärden efter kön och studie. Dessutom inkluderade genotypningskvalitetskontroll kontroll av saknade data, Hardy-Weinberg-jämvikt och könsmatchning, följt av imputation och filtrering för frekvens och noggrannhet av mindre alleler, vilket resulterade i en analys av 7 250 911 SNP:er.

Jämfört med kontrollgruppen var deltagare med CRC äldre, hade högre BMI och energiintag, och en högre prevalens av riskfaktorer såsom familjehistoria av CRC och typ 2-diabetes. De konsumerade också mindre fibrer, frukt och grönsaker jämfört med kontrollgruppen. Metaanalyser fann ett omvänt samband mellan fiberintag (relativ risk per kvartilökning (OR) = 0,79), fruktintag (OR = 0,79) och grönsaksintag (OR = 0,82) och CRC-risk.

3-DF-testet identifierade rs4730274-locuset uppströms om SLC26A3-genen, vilket visar ett samband med fiberintag och en interaktion med CRC-risk. Stratifiering efter genotyp visade ett starkare inverst samband mellan fiber och CRC för varje kopia av T-allelen. Funktionell annotering antydde förstärkaraktivitet i kolonvävnader, med en eQTL för DLD-genen.

Locuset rs1620977 nära NEGR1-genen visade ett signifikant samband med fruktkonsumtion och en måttlig interaktion med risken för kolorektal cancer. Starka inversa samband observerades med ökande fruktkonsumtion för varje kopia av G-allelen.

Studien är den största G×E-studien hittills, där forskarna identifierade två interaktioner mellan fiber, fruktintag och risk för kolorektal cancer (CRC). Mer specifikt tyder rs4730274 nära SLC26A3-genen på ett signifikant samband mellan fiberintag, tarmfunktion, inflammation och CRC. Resultaten kräver ytterligare studier för att undersöka de kliniska implikationerna och bekräfta dessa fynd i olika populationer.