H. influenzae är gramnegativa pleomorfa stavformade eller kokcoida celler som mäter (0,2-0,3) x (0,5-2) µm. De finns i utstryk enskilt eller parvis, och ibland i form av korta kedjor och grupper. På tätt medium bildar de små (upp till 1 mm i diameter) runda färglösa kolonier. Mikroorganismer är orörliga, bildar inte sporer, men bildandet av kapselformer är möjligt, med vilka patogena egenskaper är förknippade. Patogenen producerar endotoxin, vars bärare anses vara kapselpolysackarider.